在海洋有机物和细菌的类脂化合物中也含有异构脂肪酸，它们也可能是异构烃的前身。

石油中大部分异构烷烃形成于生油主带，由干l酪根中脂族结构热分解产生，此时既生成饱和烃，也生成不饱和烃。生成的烷烃经催化作用的一系列转化产生异构烷烃。异构烷烃也可能由甾类结构烃类的烷基侧链断裂产生。